初中入团申请书或相关表格中，学历应填写为“初中”。如果需要更具体，可以注明是初中几年级，例如“初中三年级”。这是因为在入团申请书或相关表格中，学历部分主要是用来简单介绍个人的教育背景，而不需要像毕业证书那样详细列出每一级的学习经历。

因此，对于初中在读学生来说，在填写入团申请书或相关表格时，学历应填写为“初中”，如果是在读年级，可以具体到“初中X年级”。这样既符合入团申请的要求，也能清晰地表明个人的教育阶段。