清朝选择日本留学的原因是多方面的，主要包括以下几点：

经济因素

相较于欧美，前往日本留学的费用较低，这对经济困难的清朝来说是一个重要考虑因素。

日本的生活费和学费都相对较低，加上地理位置相近，语言障碍小，使得很多中国学生能够负担得起留学费用，并且能够更快地适应和吸收所学知识。

文化接近

中日两国文化有较多相似之处，留学生更容易适应日本的生活和学习环境。

日本通行汉字，学习语言时间成本低，留学日本让中低层学子也有机会参与。

政治体制相似

日本的政治体制与清朝相似，都是君主制，这为清朝政府放心派遣留学生到日本学习提供了便利。

清朝统治阶级既想让留学生学习西方技术效力于朝廷，维护封建统治，又唯恐留学生接触西方民主自由思想反过来威胁皇权。

科技水平迅速提升

明治维新后，日本迅速学习西方科技，并在甲午战争中击败了中国，显示了其改革的成效，这对清朝具有很大的吸引力。

日本在军事、工业、教育等诸多领域成效斐然，让清朝统治者与知识分子看到了通过学习西方实现富强的可行性范例。

教育制度吸引

日本的教育制度在明治维新后得到重视和发展，其教育质量和制度对清朝具有吸引力。

日本在师范、医学、政治、军事等方面的教育水平较高，满足了清朝政府的需求。

政府支持

日本政府对留学运动持欢迎和鼓励态度，这进一步促进了清朝学生选择日本留学。

清末新政期间，清政府鼓励留学，并特别支持向日本派遣留学生，以学习日本的现代化经验。

实用性

清朝急需学习日本的政治、军事、师范、医学等领域的知识，以强化国力。

甲午战争后，中国败给日本，这一刺激使得更多的中国学生开始关注日本的成功经验，并希望通过留学日本来寻找国家振兴之路。

综上所述，清朝选择日本留学的原因是多方面的，包括经济上的考量、文化亲近性、政治体制的相似性、科技水平的吸引力、教育制度的吸引力、政府的支持以及实用性等因素。