留学生在日本需要准备以下证件：

护照：

国际旅行的身份证和在国外的身份证明，出发前需确保护照有效期在6个月以上。

签证：

进入日本的法律许可，根据留学计划可能需要申请学生签证（留学签证）。

在留资格认定书（COE）：

由日本法务省发放，证明已获得在日本留学的资格。

在留卡：

入境日本后，如果居留期限超过3个月，需要在机场或当地入国管理局办理在留卡，这是在日本的身份证明，需要随时携带。

资格外活动许可申请书：

如果计划在日本打工，需要在抵达日本机场时申请资格外活动许可。

再入国许可：

中长期居留外国人离境超一年需申请再入国许可，否则将失去居留资格。

国民健康保险证：

居住3个月以上的外国人必须加入国民健康保险，持有该保险证的留学生在就医时只需支付30%的医疗费用，其余70%由政府承担。

印章：

日本经常会使用印章，且通常用直径13-16毫米左右的圆章，字体一般使用繁体字。

其他补充材料：

可能包括学校申请表格、身份证正反面复印件、户口本复印件、最高学历毕业证书原件或在读证明、成绩单、日语学习证明、经费担保人的身份证正反面复印件、在职证明、收入与纳税证明、经费支付书、申请人与担保人的亲属关系公证等。

建议留学生在出发前仔细检查并准备好所有必要的证件，以确保顺利入境和在日本的生活。