留学飞日本的流程通常包括以下几个主要步骤：

准备阶段

确定留学目标和学校：了解日本的教育体制、学校教学质量等信息，选择目标学校。

准备申请材料：包括成绩单、语言考试成绩、推荐信等。

申请签证：通过签证代办机构办理签证申请。

购买机票：按照学校通知的指定日期购买机票。

出发前的准备

填写出入境确认书：在出发前填写。

健康检查：进行COVID-19检测，并准备健康卡。

行李准备：随身携带不超过10公斤的随身行李，托运行李每人2件，每件不超过23公斤。

登机流程

提前到达机场：一般建议提前三个小时到达机场。

托运行李和领取登机牌：办理行李托运手续，领取登机牌。

安检：接受手提行李的安全检查和全身安全检查。

候机和登机：进入候机区，根据登机牌提示找到正确的登机口，等待登机。

飞行途中

填写表格：飞行途中，空乘人员会发放《外国人出入境登记卡》和《关税申报单》，请在飞机着陆前填好。

健康卡和问卷调查：填写健康卡和厚生劳动省的问卷调查。

日本入境

入境审查：到达日本后，携带随身行李，根据机场指示标识前往入境审查通道，接受审查官的询问、面部高清摄影和指纹采集。

领取在留卡：审查官在护照内加盖《上陆许可印纸》，并发放在留卡。

核酸检测：根据指示进行唾液核酸检测。

入境后手续

领取行李：在行李领取处领取行李，并通过海关。

办理入学手续：根据学校安排，办理入学手续和住宿安排。

适应期

适应日本生活：注意日本的文化差异和生活习惯，做好适应和融入的准备。

以上是留学飞日本的基本流程，具体细节可能因个人情况和学校要求有所不同。建议在出发前详细阅读学校提供的入学指南，并咨询留学中介或相关部门，确保所有手续和材料都准备齐全。