入管局留学被拒签的原因可能包括以下几个方面：

学习意志和能力不足

学习履历和就学理由不匹配。

学习意志和能力的证明不充分。

日语学习经历或能力证明不可信。

提交资料的可信度问题

提交的资料存在虚假内容，如伪造文件或虚假信息。

提交的资料不足，未能充分证明申请人的经历或经费支付能力。

入国经历和在留情况

有遣返、强制驱逐或被不良记录。

没有申报过去的入国经历。

经费支付关系

未能充分证明有支付学费和生活费的能力。

资金流水和资金形成过程说明不充分。

申请目的不明确或不合理

留学动机不明确，如出国打工而非学习。

申请目的与家庭经济条件不符。

其他因素

有被拒签记录。

移民倾向。

建议在申请留学签证时，务必确保所有材料的真实性和完整性，充分证明自己的学习意志和能力，以及家庭的经济能力，以提高签证申请的成功率。