日本留学的申请费用因学校、专业、地区等因素而异，具体费用如下：

申请费用

一般来说，日本留学的申请费在2000-5000元人民币不等。

具体费用因学校和专业而异，例如，申请东京大学需要支付考试费用和申请费用，总费用约为2万日元（约合人民币1200元）。

申请费用通常在5000-10000日元之间。

材料费用

个人证件照（20元左右）。

护照（200元，首次办理护照的费用为200元/本）。

亲属关系公证（约200元，城市不同会有浮动）。

日语考试报名费（450元，N3-N5级别的报名费用为450元人民币）。

没有毕业的，需要做高考/会考成绩认证或者需要做最终学历认证的（大约150元左右）。

签证费（500~900元，因地区和选择的代办机构而异）。

存款证明（20万现金存入五大行开存款证明和存单）。

其他费用

学费：语言学校学费大约在70-80万日元/年（约合人民币3.5-4万），国公立大学学费约为220万日元/年（约合人民币11万），私立大学学费根据专业不同，费用较高，普通文理科专业一年的学费在5万-8万人民币左右，艺术类、设计类专业费用较高，每年的学费金额大概在8-10万人民币左右。

住宿费：学校宿舍费用大约在5000日元-2万日元/月（约合人民币300-1300元），校外租房费用因地区而异，东京等大城市可能达到3600-5000元人民币/月。

生活费：每月在4-10万日元（约合人民币1800-6500元）之间，包括饮食、交通、水电煤气费、日常用品等费用。

保险费：须加入日本国民健康保险，月保费约2000-3000日元。

综上所述，留学日本的申请费用和其他相关费用因个人选择的学校、专业、地区等因素而有所不同。建议在选择留学计划和学校时，详细了解各学校的具体费用，并提前做好相应的准备。