南非硕士留学所需的保证金金额如下：

银行存款证明：

至少需要5万元人民币。

使馆保证金：

15000元人民币。

因此，总共需要的保证金为：

5万元人民币（银行存款证明） + 15000元人民币（使馆保证金） = 20000元人民币。

建议：

确保在申请签证前，银行账户中有足够的资金来证明至少5万元人民币的存款。

准备好15000元人民币的使馆保证金，并确保在签证申请过程中能够及时提交。

请注意，这些金额可能会随时间变化，建议在申请签证前，再次确认最新的签证要求和费用。