日本三本大学（私立大学）的学费如下：

私立文科：

396万日元/年，约合人民币23万元。

私立理科：

539万日元/年，约合人民币31万元。

私立医齿科：

2337万日元/年，约合人民币137万元。

因此，日本三本大学的学费大约在 5-6万元人民币/年之间。

建议根据具体专业和学校的实际情况，进一步确认学费信息，因为不同学校的收费标准可能会有所不同。