去日本短期留学需要的费用大致如下：

学费

短期90天留学的入学杂费和学费约为20~25万日元。

短期留学一个月的学费约在人民币5600元左右。

住宿费

租一间4.5到6.0层的小房间，价格在2万到3万日元之间，但需要支付6个月的费用，至少12万日元。

家庭寄宿的费用大约为每月8万到12万日元。

合租公寓的费用一般在每月10万到15万日元之间。

学校宿舍的费用相对较低，大约每月5万到8万日元。

生活费

每月的生活费用大约在8万到10万日元之间。

伙食费每月大约在2万到5万日元之间，如果自己做饭则较低，经常外出就餐则较高。

交通费用每月大约在5000到15000日元之间，具体费用取决于居住地与上课地点的距离。

其他费用

签证费用约为2到3万日元。

综合以上费用，去日本短期留学三个月的总费用大致在40万到80万日元之间，具体支出视个人选择而定。如果选择合租公寓并自己做饭，费用可能会相对较低，大约需要30万到40万日元。如果选择学校宿舍并经常外出就餐，费用可能会接近50万日元。

建议：

预算规划：根据个人经济情况，制定详细的预算计划，包括学费、住宿费、生活费和其他费用。

勤工俭学：如果经济条件有限，可以考虑在日本进行勤工俭学，以减轻经济压力。

选择学校：不同学校和专业的学费和生活费用有所不同，选择合适的学校和专业可以节省不少费用。

提前准备：提前了解并准备好所有必要的申请材料，以确保签证申请和入学手续的顺利进行。