来日本留学的手续费用包括多个方面，具体费用如下：

考试费

N1、N2报名费为550元；N3、N4、N5报名费为450元。

申请费

一所学校的手续费大约为200元，申请多所学校则需要缴纳多份手续费。

签证费

签证手续费大约为几百元，此外还需进行体检，体检费用约为1000元。

入学费

语言学校首年入学费用约为4000元人民币，其中入学手续费约为8万日元，折合人民币约4000元。

大学首年入学费用约为1万元人民币，其中入学手续费约为20万日元，折合人民币约1万元。

其他费用

机票费用：1000~5000元人民币。

申请材料的邮寄费用：EMS/DHL 300-500元人民币。

住宿费、生活费和其他杂费：具体金额因学校类型、地区和个人生活方式的不同而有所差异。

综合以上费用，来日本留学的总手续费大约在1万元至几万元人民币之间，具体费用还需根据个人选择的学校、专业、住宿情况以及其他生活开销来计算。

建议：

在准备留学手续时，建议提前了解并确认各项费用，以便做好充分的预算和准备。

考虑到签证费用和体检费用等，建议留出足够的时间进行准备，以免影响留学计划。