申请日本留学的佣金（中介服务费） 大约为1万元人民币左右。此外，还需要考虑境外服务费，这一费用通常在3万元人民币左右。因此，综合来看，申请日本留学的最高费用可能会达到4万元人民币。

需要注意的是，这些费用并不是固定不变的，具体费用可能会根据学生申请的院校排名、专业热门程度、服务质量等因素有所调整。一些机构可能会提供更为全面的服务，如签证申请、文书指导、语言培训等，这些服务可能会收取额外的费用。

在选择留学中介时，学生应仔细比较不同中介的收费标准和服务内容，避免被高额利润承诺所误导。了解透明信息，确保中介的收费合理且透明。