在留学申请中，"refer"一词通常有以下几种含义：

推荐或提及：

在某些情况下，"refer"可以指通过找已经被录取的学生，在拒绝邮件中向学校及导师推荐你，相当于内部推荐。

成绩达标：

有些学校会有一个"refer"的规定，即申请者的成绩是否达标。如果成绩达标，则可能被直接录取。

补考机会：

在学术成绩方面，"R"可能代表"Restudy"，意味着允许学生补考。

网络英语中的referral：

在网络英语中，"refer"还常作为"referral"所对应的动词，意即“推介”，如refer your friend。

综上所述，"refer"在留学申请中主要涉及推荐、成绩达标和补考机会等含义，具体用法需要根据上下文来判断。