清朝留学儿童回国的主要原因可以归纳为以下几点：

学业考核：

清政府为了确保留学资金的有效利用，定期对留学生进行严格考核。不合格的学生会被遣送回国，以确保只有有才能的学生继续留学。

生活适应性问题：

许多幼童在适应美国的生活环境方面面临巨大挑战，包括语言障碍、文化差异、生活习惯等。一些孩子因不适应新环境而生病甚至死亡，部分人因此选择提前回国。

政治和文化因素：

一些留学生在美国学习期间受到西方文化和思想的影响，对清政府的统治产生质疑和抵触情绪。他们可能剪辫子、穿洋装，甚至参与一些不符合封建礼教的行为，这使清政府认为他们无法再接受传统的儒家教育，因此决定提前召回。

个人选择：

部分留学生在美国期间已经取得了显著的学术成就，并且由于国内教育条件相对滞后，他们可能不愿意回国，希望继续在美国深造。此外，一些留学生可能因为个人原因，如家庭背景、个人发展等选择留在美国。

健康问题：

长途跋涉和适应新环境对年幼的留学生来说是非常艰难的，一些孩子在途中或在美国因水土不服而病逝。

政府政策变化：

清政府的政治变化，如政权挫败、外交政策调整等，也可能影响留学生的去留。例如，美国拒绝清政府学生进入军校学习，以及“排华”浪潮的兴起，都使留学生的处境更加困难。

综上所述，清朝留学儿童回国的原因是多方面的，包括学业考核、生活适应性问题、政治和文化因素、个人选择、健康问题以及政府政策变化等。这些因素共同作用，导致部分留学生提前回国，部分选择继续留在美国。