灵活就业人员不能退全款的原因主要有以下几点：

缴费结构：

灵活就业人员需要自己承担全部社保费用，其中60%进入统筹账户，只有40%进入个人账户。因此，如果选择退保，只能退回个人账户中的部分资金，大约占缴费总额的40%。

统筹账户的作用：

统筹账户的资金用于支付所有参保人员的养老金、医疗保险等费用，具有互助共济的作用。如果允许灵活就业人员全额退款，统筹账户的资金将会枯竭，严重影响整个社保体系的稳定和可持续发展。

社保体系的整体运行：

社保体系需要依靠所有参保人员的缴费来维持运行，包括已经退休的人员。如果允许灵活就业人员随时全额退款，将会破坏社保体系的平衡，影响养老金的按时足额发放。

现行政策：

根据《社会保险费征缴暂行条例》，灵活就业人员退保只能退回个人账户部分，不能全额退款。这一政策已经考虑到了社保体系的整体利益和长远发展。

综上所述，灵活就业人员不能退全款的原因在于社保缴费的结构、统筹账户的互助作用以及社保体系的整体运行需要。虽然这一政策对灵活就业人员来说可能不太公平，但从整体社会利益和社保体系的稳定来看，全额退款并不可行。