机关签就业协议有以下作用：

保障毕业生在寻找工作阶段的权利与义务

就业协议书可以约束签订劳动合同的时间和劳动合同的内容，确保在签订劳动合同时，其内容符合就业协议的约定。如果发现劳动合同与就业协议不一致，特别是出现对维护毕业生权益不利的情况时，毕业生可以要求用人单位按照已经签订生效的就业协议制定新的劳动合同。

保障用人单位能方便地直接从学校方面调出毕业生的真实档案和资料

就业协议书使得用人单位能够方便、清楚地了解毕业生的真实情况，包括个人人事档案记录、工龄计算等，这对用人单位的选拔和参考具有重要意义。

作为就业报到证明

毕业生凭就业协议书办理人事关系（户口档案等）的迁移，是高校毕业生就业报到证的作用之一。

个人人事档案记录

毕业生落实就业单位并签订协议后，档案开始记录工作历程，对个人职业发展极为重要。

劳资关系保障

签订就业协议书是保护毕业生在用人单位工作的切身利益，包括意外工伤、劳资纠纷、各种福利金等个人利益。

身份标志

持有高校毕业生就业报到证是正规高校毕业生的标志。

工龄计算

签约后档案里会有工龄记录，是以后评职称的基础。

人事代理手续

只有签订了就业协议书才能办理人事代理手续，否则档案可能会被派回生源地。

户口挂靠

在规定时间内落实单位并签订协议的，户口可以直接挂靠落实单位所在地。

用人单位选拔参考

在招聘高峰期，就业协议书是用人单位了解毕业生情况的重要参考。

明确权利义务

就业协议书规定了毕业生和用人单位在就业期间的权利和义务，以及就业关系终止后的权利和义务，防止未来可能出现的工资纠纷。

防止劳动纠纷

通过明确工作内容、薪资待遇等，避免未来可能出现的工资纠纷。

保护商业机密

就业协议书中可能包含保密条款，保护公司的商业机密不被泄露。

综上所述，机关签就业协议在保障毕业生和用人单位的权益、规范就业工作、办理人事档案和户口迁移等方面具有重要作用。建议毕业生在签订就业协议时，务必仔细阅读协议内容，确保自己的权益得到充分保障。