关于日本出国留学档案的处理，有以下几种方式：

学校保管

优点：部分学校提供户口档案留校服务，一般免费保留一到两年，可以以应届生身份参加公务员考试等。

缺点：不是所有学校都提供此服务，两年后档案若无接收单位会打回原籍，且留学期间档案空白，不算工龄。

原籍的人才市场

优点：手续简便，免费，正规的人事部门有保管档案的权利，留学回国后就业手续方便。

缺点：留学期间档案空白，不算工龄，可能会失去应届生的身份（如不能参加某些要求应届生的公务员考试）。

教育部留学服务中心

优点：专门为出国留学人员提供档案代管服务，档案托管较为规范，可避免档案丢失或空白。

缺点：需要准备较多材料并在线申请，可能相对繁琐一些。

个人手中保管

注意事项：档案一定不能放在个人手中保管，因为以后需要调档时，必须从有保存档案资质的机构以机密形式寄出。

建议

提前咨询学校：在毕业前，务必咨询自己学校的户口和档案处理政策，了解是否可以档案留校以及具体的保管期限和要求。

选择正规机构：无论选择哪种方式，都应确保档案存放在有保管档案资质的机构，避免档案丢失或空白。

准备齐全材料：如果选择学校保管或教育部留学服务中心，需要提前准备好所有必要的材料，并按照要求办理手续。

通过以上方式，可以确保你的留学档案得到妥善处理，避免未来就业或升学时出现不必要的麻烦。