三本学生想要去日本留学，可以参考以下步骤和建议：

选校和专业

选择在日本教育部认证的大学，确保所选择的学校是有官方认证的大学。

在三本院校中，可能并没有太多专业直接对口日本的某些专业，可以考虑选择与自己专业相近或具有一定跨学科性的专业进行申请。

注意申请该专业需要具备的能力和背景。

语言水平

除了通过托福或雅思考试获得英语授课的机会外，很多日本院校还需要外国学生通过日本语言能力测试（JLPT）来展示自己的日语水平。

三本学生在选择日本院校时，需要了解该校对于日语要求的具体情况，并在申请前做足准备。日语水平不够的学生可以先报名参加一些语言学校的日语课程，提升自己的日语水平。

文书准备

文书是申请留学的重要材料，也是日本大学招生委员会考虑录取与否的重要参考。

个人陈述：着重阐述自己为何要来日本留学，以及在日本学习期间自己的学术目标与计划。

推荐信：推荐信需要从老师或导师处获得，重点介绍自己的学习状况和实践经历，展示自己的学术潜力。

成绩单：日本大学会比较看重申请者的成绩单，包括个人的学科绩点、总绩点以及通过的托福或日语能力测试成绩。

申请材料的递交步骤

在准备好所有申请材料后，通过学校官网递交材料，有的学校会要求递交纸质材料。

递交申请材料可以通过国际快递、邮寄等方式进行。

考虑申请研究生

三本院校的学生可以考虑先申请日本的研究生（硕士预科），赴日后参加日本大学院修士入学考试，考试通过后就可以顺利读修士（硕士）。

需要确保毕业后有学位证和毕业证，有一定的日语成绩，建议至少N2及以上。

费用考虑

费用方面，半年研究生+2年修士基本上不考虑打工，不考虑奖学金的情况下，学费+生活费基本上需要25万人民币左右。

个人能力和自理能力

出国留学需要学生具备较强的个人自理能力，因为父母不在身边，需要自己处理生活和学习中的各种事务。

具体问题具体分析

在申请过程中，需要具体问题具体分析，一切从实际出发，根据个人情况和目标来制定合适的留学计划。

通过以上步骤和建议，三本学生可以更好地准备和申请日本留学，实现自己的学术和职业目标。