如果日本留学生确诊，需要按照以下步骤办理相关手续：

就医并获取诊断证明

前往医院，提交个人基本资料并填写问诊表，包括病史和药物过敏等信息。

进行体检，医生会根据问诊表和体检情况开具处方签。

拿着处方签到附近的药局购药。

获取健康证明

到各地国际旅行卫生保健中心申请外文健康证明，这通常是出入境检验检疫局下属事业单位提供的服务。

需要准备几张两寸照片，并可能需要支付额外的翻译费用。

一般三个工作日后可以领取结果，并同时办出小红本。

报告确诊情况

将健康证明和诊断证明提交给所在大学或相关部门，告知他们确诊情况。

根据学校或相关部门的要求，可能需要进一步填写表格或进行其他手续。

遵循当地卫生部门的指示

根据确诊情况，遵循当地卫生部门的指示，进行必要的隔离和治疗。

注意个人卫生和防护措施，避免病毒传播。

建议：

在确诊后，及时与所在大学或相关部门沟通，了解具体的报告程序和要求。

准备好所有必要的文件和证明，以便顺利办理各项手续。

注意个人健康和安全，遵循医生的建议进行治疗和隔离。