日本留学生退出年金的计算方法如下：

国民年金

如果在离开日本或丧失年金资格不超过2年内退出，可以退还国民年金和厚生年金的一时补助。

国民年金的一时补助全额退还，不扣所得税。

厚生年金的一时补助为加入期间的平均月工资乘以加入年数（年数以半年为单位，最大不超过3年），但实际到账金额会扣除30万日元的所得税，需要通过退税手续申请退还。

厚生年金

退还的金额根据参保月数计算，最多只能退36个月的年金，即3年。不足3年的，按照实际交付的月数退还，但最低要求是交够6个月以上。

如果在日本居留多次，加入日本年金制度期间合算达37个月以上者，需要每次居留结束回国时进行申请。

厚生年金分两次返还，第一次领取期限为两年，否则视为自动放弃。第一次申请后，还有5年内可以申请第二次返还。

其他注意事项

退下来的钱是日元，会根据当日日元兑人民币牌价进行结算。

年金手帐原件是必须的，但如遇特殊原因不能提供，也可提供年金手册复印件或年金番号。

退出补助金的领取期限较严，需要在规定时间内申请，逾期未申请则视为自动放弃。

建议

及时申请：留学生在离开日本前或丧失年金资格后应尽快申请退出年金，以免错过相关补助。

了解政策：详细阅读并了解日本年金机构的政策，确保申请过程中所需材料齐全。

咨询专业人士：如有疑问，可以咨询专业的年金顾问或律师，以确保申请过程顺利。