选择知名的日本留学时，可以从以下几个方面进行综合考虑：

地理位置

东京：国际化程度高，机会丰富，适合注重社交和实践机会的学生。

京阪神地区（京都、大阪、神户）：学术研究实力强，适合注重学术研究的同学。

东京以外地区：如大阪、京都、名古屋、神户等，消费水平适中，适合不同需求的学生。

申请难度

日本大学院的申请需要考虑报录比，尤其是头部院校竞争激烈。提前了解各大学的申请时间和具体要求，合理安排时间，提高申请成功率。

专业和研究方向

选择大学时，深入了解导师的科研方向和兴趣，确保与自己的研究兴趣一致。日本大学院阶段需要在导师的研究室进行学习，研究方向的匹配度直接影响到申请的成败。

学校类型

国公立大学：教学质量高，学费较低，但竞争也较为激烈。

私立大学：认可度高，实力强，部分学校如早稻田大学、庆应大学等也受到大型企业的青睐。

学费和生活费用

了解各学校的学费和生活费用，选择经济承受能力范围内的学校。注意，语言学校的学费差异较大，从66万日元到86万日元不等。

语言能力

日本留学需要具备一定的日语水平，通常需要提交日本留学考试（EJU）的成绩或托福、雅思等英语成绩。

学术和社会经验

积极参与学术研究、社会实践、志愿者活动等，丰富自己的简历和个人陈述，增加竞争力。

未来职业规划

根据自己的职业规划选择学校和专业，考虑未来工作的需求和就业前景。日本大型企业普遍青睐来自名校的学生。

学校排名和专业排名

参考学校的综合实力、学科优势、师资力量等，选择排名较高的学校。专业排名也是重要参考因素，尤其是对于希望专业对口的学生。

留学服务机构

选择靠谱的留学机构，获取专业的选校咨询、学业规划、语言辅导等服务，提高留学申请的成功率。

综合考虑以上因素，选择合适的日本留学需要全面评估自己的需求、兴趣和目标，同时做好充分的准备和规划。