对于日本留学毕业证的认证，通常需要经过以下几个步骤：

在线查询

日本大学通常设有在线学籍查询系统，学生可以登录该系统查询学校的各种学籍信息，如成绩、课程记录和选修记录等。使用这个系统的好处是随时查看自己的学籍信息，并且可以节省寻找学籍信息的时间和精力。只需输入学校给定的账户名和密码即可查询学籍。

传统方式查询

如果在线平台无法查询，学生可以使用传统方式查询学籍。方法包括书面查询和现场查询。书面查询需要向学校的所在部门提交申请，并填写必要的信息，如姓名、出生日期、学号等。学校将根据这些信息查询相应的学籍信息。现场查询则需要携带个人身份证件和学生证明到学校的教务处、学工处等相关部门进行现场查询。

学历认证报告

如果日本入国管理局怀疑学历证明的真实性，可能会要求提交学历认证报告。正规的手续需要提供原件，校方一般会在网上查验。

公证认证

学成归国后，需要将日本大学毕业证进行公证认证，才能使其在国内得到承认和应用。具体的认证流程包括将毕业证进行公证，然后进行认证。这一过程通常需要到当地的公证处进行公证，并由公证处将公证书送到外交部领事认证中心进行认证，最终由外交部领事认证中心将认证好的公证书送到日本驻华大使馆或领事馆进行认证。

建议：

在留学期间，尽量妥善保管好所有的学籍信息和证明文件，以便在需要时能够迅速提供。

了解并熟悉所在大学的学籍查询系统和查询流程，以便在需要时能够方便快捷地获取自己的学籍信息。

在毕业前，了解并准备好学历认证所需的材料和流程，确保在归国后能够顺利办理学历认证。