深圳初中最好的学校主要包括以下几所：

深圳中学：

创办于1947年，是广东省一级学校和国家级示范性普通高中，以其悠久的历史、高质量的教学和全面的学生发展而著称。

深圳外国语学校：

创办于1990年，是广东省一级学校，以英语教育和小语种教育闻名，是全国首批可保送20%毕业生上重点大学的外国语学校之一。

深圳实验学校：

成立于1985年，是深圳市教育局直属学校，实行一体化管理，注重素质教育，关注学生个性发展，拥有丰富的教育资源和先进的教学设施。

深圳高级中学：

成立于1997年，是深圳市公办完全中学，以科技教育特色知名。

南山第二外国语学校：

建于2004年，是九年一贯制公立学校，注重外语教育，是国家级基础教育实验中心外语教育研究中心实验学校。

深圳市百合外国语学校：

市优质民办学校，位于龙岗布吉，校园设施完善，坚守深外名校风范和外语特色。

红岭中学：

享有良好的声誉，中考成绩优异。

宝安中学初中部：

宝安区优质初中之一，教学质量高。

南实教育集团麒麟中学：

南实教育集团旗下的优秀学校。

深圳市育才三中：

以优秀的教学质量和学生全面发展著称。

这些学校各有特色，家长和学生可以根据自身需求和兴趣选择适合的学校。建议综合考虑学校的教学质量、师资力量、学生综合素质培养以及硬件设施等方面进行选择。