在初中教师资格证考试中， 科目三《学科知识与教学能力》被认为是最难考的。这一科目不仅要求考生掌握本学科的知识和技能，还需要具备一定的教育教学能力，包括教学设计、教学实施和教学评价等方面。对于非师范专业的考生来说，这一科目的难度可能会更大，因为他们需要额外学习如何设计和实施教学活动。

此外，虽然科目一《综合素质》和科目二《教育知识与能力》也有一定的难度，但相比之下，科目三的难度更为突出，因为它直接关系到考生是否能够胜任未来的教学工作。

建议考生根据自己的兴趣和专长选择报考科目，并提前进行充分的准备和复习，以提高通过考试的几率。