日本留学生可能最怕的问题包括：

学历不够：

需要至少高中毕业学历才能申请赴日留学读语言学校，否则可能没有资格申请。

学习能力不足：

有些语言学校还会要求提供高考成绩，以评估学生的学习能力。

学习日语不专心：

现在有些语言学校会要求提供日语能力证明，如J-Test成绩，以显示学生赴日留学是有准备的。

家庭资金不足：

如果学生以打工为目的，需要合理体现经费支付人的工作及收入情况，否则可能因资金问题而被拒。

安全问题：

包括避免接触可能进行宗教宣传的传教士、NHK签约人员以及其他不良分子和行为异常者。

合租问题：

合租可能引发金钱和生活习惯上的纠纷，尤其是与室友在共用资源如水电费、家具购置等方面可能出现分歧。

语言忌讳：

日本人有一些语言忌讳，例如“苦”和“死”等词语及其谐音，这些在正式场合或日常交往中需要特别注意。

行为禁忌：

在正式社交场合，男女需穿西装礼服，忌衣冠不整、举止失措和大声喧哗。在饮食中，也有一些忌讳，如不使用某些数字和盛饭方式。

过度打工：

虽然打工是留学生了解日本生活的一个途径，但过度打工可能会影响学业，甚至违反签证规定。

社交禁忌：

例如送礼时避免送成双成对的礼物，因为“2”这个数字容易导致夫妻感情破裂。此外，在正式场合穿着不整、举止失措或大声喧哗都是不被接受的。

签证和出勤率：

保持高出勤率是留学期间的重要任务，否则可能会被入管局认为没有学习诚意，从而影响签证的续签甚至被遣返。

非法打工：

留学生在日本非法打工是违法行为，一旦被发现，可能会面临严重的法律后果，包括被遣返。

这些是留学生在赴日留学过程中可能面临的一些主要问题和挑战。建议留学生在申请和留学期间，充分了解并准备应对这些问题，以确保留学顺利进行。