鲁迅在日本留学期间， 主要使用日语和中文进行交流。

日语：

鲁迅在日本留学期间，日常生活和学术活动中主要使用日语。他曾在仙台医专学习，那里的课程和讲义都是用日语进行的。

中文：

尽管鲁迅在日本期间主要使用日语，但他也时常使用中文进行写作和思考。他的许多重要作品，如《狂人日记》、《呐喊》和《彷徨》，都是在留学期间用中文创作的。此外，鲁迅在与藤野先生的交流中，也使用中文。

综上所述，鲁迅在日本留学期间，主要使用日语和中文进行交流，但更偏向于日语，中文则主要用于写作和与藤野先生的交流。