日本留学认证代办费用如下：

基本费用

签证手续费：一次有效签证为200元人民币，多次有效签证为400元人民币。

代办费用：如果委托代办机构办理，会另外加收200元人民币。

其他费用

签证更新申请费：4500日元（约合人民币225元）。

事务代办费：500日元（约合人民币25元）。

邮费：将材料提交给学校可能需要一定的邮费。

其他可能的费用

公证费用：每份证件几百元不等。

翻译费用：根据不同的翻译机构和证件种类而不同。

快递费用：将准备好的证件和公证申请表递交给公证机构，公证机构将公证书寄回给留学生。

其他费用：可能包括文件复印费、快递费用、资料处理费、专业评估费等。

综合以上信息，如果委托代办机构办理日本留学签证，总费用大致在 1000元人民币至1500元人民币之间，具体费用可能会因代办机构的不同而有所差异。建议在选择代办机构时，详细询问并了解所有可能产生的费用，以便做好充分准备。