日本单次留学签证的费用如下：

一般费用

一次有效签证：200元人民币。

多次有效签证：400元人民币。

代办机构费用

如果选择委托代办机构办理，则另外加收200元人民币。

总费用为400元（签证费）+ 200元（代办费）= 600元人民币。

其他费用

签证费用可能会根据每年的汇率变化进行调整，建议以办理时的官方公告为准。

建议：

如果签证为一次有效，费用为200元人民币。

如果签证为多次有效，费用为400元人民币。

考虑委托代办机构办理时，总费用为600元人民币。

请注意，以上信息仅供参考，具体费用可能会有所变动，建议在办理签证前，通过官方渠道或代办机构获取最新费用信息。