上海交通大学就业率较低的主要原因在于 毕业生的主要毕业去向是升学。根据2024年6月8日前的数据，上海交通大学的升学人数共计2646人，占毕业生总数的67.60%，其中出国（境）留学的人数为645人，占17.60%。这表明大部分学生在完成本科或研究生学业后，选择继续深造而非直接进入职场。

此外，虽然上海交通大学的本科毕业生平均签约年薪为12.78万元，研究生平均签约年薪为14.60万元，本科生年薪集中于9-11万元，最高可达42万元，研究生年薪集中于10-13万元，最高可达48万元，但较高的薪资水平并未直接转化为高就业率，因为许多学生更倾向于通过升学来进一步提升自己的职业竞争力或寻求更好的学术环境。

综上所述，上海交通大学就业率低的主要原因是大部分毕业生选择继续升学，而非直接就业。