企业应缴纳的残疾人就业保障金在会计核算中应计入 管理费用科目。具体会计处理如下：

计提时

借：管理费用——残疾人就业保障金

贷：其他应付款——残疾人就业保障金

实际缴纳时

借：其他应付款——残疾人就业保障金

贷：银行存款

此外，根据《残疾人就业保障金征收使用管理办法》（财税〔2015〕72号）的规定，企业超比例安排残疾人就业或者为安排残疾人就业做出显著成绩，按规定收到的奖励，应计入“其他收益”科目；企业未按规定缴纳残疾人就业保障金，按规定缴纳的滞纳金，应计入“营业外支出”科目。

因此，综合以上信息，企业应缴纳的残疾人就业保障金主要计入“管理费用”科目，而相关的奖励和滞纳金则分别计入“其他收益”和“营业外支出”科目。