档案放在就业局的原因主要有以下几点：

身份管理

就业局主要管理改制、破产、关停或失业期满的职工工人档案，以及省内行业中买断工龄的职工或自由职业者的档案。这些人员的档案放在就业局代表的是普通工人身份，而非干部身份。

流动性管理

档案放在就业局较为稳定，一般不会再转出，会一直缴费到退休。因此，调取档案的手续相对麻烦。

管理与服务

就业局作为人力资源和社会保障部门的一部分，承担着就业管理和人才流动的职责。将档案放在就业局，可以方便相关部门进行就业服务、政策制定和执行，同时也有利于保障个人权益。

费用问题

相较于人才市场，将档案放在就业局可能涉及的费用较低，这也是部分人选择将档案存放在就业局的原因之一。

综上所述，档案放在就业局主要是为了便于管理和就业相关的服务，同时也有利于保障个人权益。对于不同身份和需求的人群，选择将档案放在就业局还是人才市场，可以根据个人实际情况和需求进行选择。