就业补贴停止申请的原因主要有以下几点：

系统升级改造

系统升级是暂停受理业务的主要原因之一。通过系统升级，可以提高补贴申请效率，优化就业服务，保障数据的安全和系统的功能提升。

经济形势和就业市场变化

随着经济的快速发展和就业市场的不断变化，政府可能需要调整和完善就业政策，以适应市场需求，提高补贴资金的使用效率。这种调整可能暂时停止受理补贴申请，以便更好地适应市场变化。

财政压力

随着高校毕业生的逐年增加，就业补贴的财政负担也在不断加重。政府需要审慎考虑各项支出的必要性和有效性，因此可能会取消就业补贴，以优化财政支出结构，提高资金使用效率。

政策调整

政策调整可能旨在激发大学生到基层就业的积极性，减少对补贴的依赖，从而引导毕业生更加关注自身的专业技能和综合素质提升，以适应市场需求的变化。这种调整可能表现为暂停受理补贴申请。

人才政策收紧

随着人才市场的竞争加剧，各地政府都在探索更加精准、高效的人才引进和培养机制。取消就业补贴可以视为政府在人才政策上的一次“精准施策”，以吸引和留住真正符合城市发展需求的高素质人才。

综上所述，就业补贴停止申请的原因是多方面的，包括系统升级改造、经济形势和就业市场的变化、财政压力、政策调整以及人才政策的收紧。对于正在申请补贴的用人单位和劳动者来说，这些变化可能带来一定的不便，但从长远来看，这些调整有利于提高补贴申请效率，优化就业服务，促进市场需求的适应和个人发展。