在日本留学时，支付房租的方法主要有以下几种：

直接支付给房东

留学生通常需要与房东直接签订租赁合同，并按月支付房租。支付方式可以是现金、银行转账或其他双方认可的方式。

通过学校支付

一些学校会提供住宿服务，留学生可以通过学校支付房租。例如，某些学校的留学生中心会提供带有家具和家电的宿舍，房租通常以日本学生标准的三分之一收取。这种情况下，留学生无需直接支付房租，但可能需要支付其他额外费用，如水、电、煤气费等。

第三方支付平台

在日本，有些房屋租赁平台允许留学生通过在线支付房租。这些平台通常会提供便捷的支付方式，如信用卡或银行转账。

银行转账

留学生可以通过银行转账的方式将房租支付给房东。在转账时，建议注明汇款用途，以便房东确认收款。

建议

提前了解合同条款：在签订租赁合同前，务必仔细阅读合同条款，了解房租支付时间、方式及其他相关费用。

选择安全的支付方式：尽量选择安全的支付方式，避免使用现金支付，以减少丢失或被盗的风险。

了解当地法律法规：不同地区可能有不同的租赁法律法规，建议了解当地的相关法律法规，以避免不必要的麻烦。

通过以上方法，留学生可以顺利支付在日本留学的房租。