东京留学回国办理的相关手续如下：

《留学归国人员证明》

办理机构：中国驻日本国大使馆教育处

办理地点：东京都江东区平野2-2-9

交通：都营大江户线清澄白河站A3出口、东京地下铁半藏门线清澄白河站B2出口、东京地下铁东西线门前仲町站1番出口

办理时间：每周周一、周四上午9点-12点、下午2点到6点（法定节假日除外）

费用：免费

所需材料：护照原件及复印件、学位证原件及复印件、来日本后的简历（中文）

日本外务省的学历认证

办理机构：日本外务省

办理地点：东京都千代田区霞关2-2-1

交通：东京地下铁日比谷线霞关站A4、A8出口

费用：免费

所需材料：毕业证原件、成绩证明书原件

中国驻日本国大使馆的学历认证

办理机构：中国驻日本国大使馆

办理地点：东京都港区元麻布3-4-33

交通：东京地下铁日比谷线六本木站徒步15分钟

办理时间：平日的上午9点-12点

费用：3000日元

所需材料：护照原件及复印件、外国人登录证原件及复印件、日本外务省的学历认证书原件及复印件、大使馆的专用申请表格、毕业证、学位证原件

再入国许可

办理机构：日本入国管理局

适用人群：离开日本一年以后才返回日本的同学

申请费用：一次再入国申请费用为3000日元，多次再入国申请费用为6000日元

办理时间：需要提前申请，具体流程和所需材料请咨询日本入国管理局

其他手续

学校相关手续：向学校老师说明回国计划，填写相关表格，领取修证明书、毕业证明书等证明文件

宿舍相关手续：结清房租、水电费、燃气费等，清理宿舍，办理转出登记

市役所相关手续：办理转出登记（転出届け），解约国民健康保险

银行账户和手机卡：注销银行账户，办理解约手机卡

建议提前了解并准备好所有所需材料，以确保办理过程顺利。如果有任何疑问，建议联系相关机构或专业人士进行咨询。