初中阶段不能入团的原因主要有以下几点：

年龄限制：

根据《团章》规定，申请入团的青年必须年满14周岁。初中一年级的学生通常只有13岁左右，不满足年龄要求。

入团申请书：

入团需要提交入团申请书，如果学生没有提交申请，组织上是不会主动发展其入团的。

未达到合格团员标准：

入团不仅需要年龄满14周岁，还需要在思想、学习、行为等方面表现出色，达到合格团员的标准。如果学生在这些方面表现不佳，组织上是不会发展其入团的。

宣传力度不足：

初中阶段共青团的宣传力度不够大，很多同学对共青团的意义和加入共青团的意义了解不足，导致没有加入共青团。

名额限制：

学校的入团名额通常有限，且入团要求日益严格，很多优秀的学生可能因为名额限制而无法入团。

其他因素：

有些学生可能因为家庭背景（如教师子女或干部子女）等因素，在入团竞争中处于不利地位。

综上所述，初中阶段不能入团的原因主要包括年龄、入团申请书提交、未达到合格团员标准、宣传力度不足、名额限制以及其他一些特定因素。建议初中生在入团前要充分了解入团的要求和条件，积极准备，努力提高自己的综合素质，争取早日加入共青团。