在初中阶段，学生若因身体原因需要保留学籍，可以采取以下步骤：

申请休学：

学生需向就读学校提交休学申请，并提供县级以上医院的诊断证明等相关资料。

学校审核：

学校审查学生提交的材料，确认其符合休学条件后，会报上级教育主管部门批准。

办理手续：

获得批准后，学生需按照学校的要求办理休学手续，并签订相关协议，明确休学期间的权利和义务。

保留学籍：

在休学期间，学生的学籍将被保留，但需按期缴纳学费。

复学：

休学期满后，学生可申请复学，并需向学校提交复学申请及相关证明材料。

需要注意的是，保留学籍通常适用于因病或其他特殊原因无法到校学习的学生，对于违反学校规定的不良行为，学校可能会采取其他措施，如回家反省教育或转学到其他级别低的学校。

此外，保留学籍的有效期一般为一年，若需延长，必须重新提交申请并提供进一步的说明和证明。

建议：在申请保留学籍时，学生和家长应详细了解当地教育主管部门的具体规定和流程，确保申请过程顺利。同时，由于保留学籍会影响学生的学业进程，建议家长和学生充分评估自身情况，慎重决定。