灵活就业人员在九月份交不上社保费的原因可能有多种，以下是一些常见的原因及解决方法：

系统故障或网络问题

如果社保系统出现暂时性故障或者由于网络问题导致缴费不成功，建议稍后尝试或等待系统恢复后再进行操作。

银行账户问题

银行账户状态异常，如存在冻结、挂失、销户等情况，会导致扣款失败。

确保银行账户内可用余额充足，以应对可能的社保费用扣款。

扣款协议问题

如果扣款协议失效，需要重新签订扣款协议。

缴费标准变化

每年社保基数调整后，个人缴费金额也会相应发生变化。确保按照新的缴费标准进行缴费。

未按规定时间缴纳

灵活就业医保需要按照每年的规定时间进行缴纳，如果错过了这个时间，就无法进行缴纳。

信息填写错误

在填写缴费信息时，如果信息有误，也会导致无法完成支付。因此，在填写信息时，一定要仔细核对，确保信息的准确性。

其他未知因素

如果以上情况都排除，可能存在其他未知因素导致缴费不成功，建议直接咨询当地社保局或相关部门寻求帮助。

根据以上原因，建议灵活就业人员首先检查自己的银行账户状态和余额，确保信息填写准确，并留意每年的缴费时间。如果问题仍然存在，建议及时联系当地社保局或相关部门进行咨询和解决。