日本留学生打工的税金主要包括国税和地方税两部分，具体收取方式如下：

国税

源泉征收：从打工的工资中直接扣除的部分称为所得税的国税，由用人公司或商店代替本人向国家（税务局）缴纳。根据工资额的不同，所得税的金额也有所差异。例如，翻译等工作的工资一般要扣除总额的10%作为所得税，而住在日本不满一年的人或一次拿工资超过100万日元的人要扣除20%的所得税。

确定申告：留学生需要每年进行“确定申告”，即在每年的2月16日至3月15日期间，到管辖自己所居住的区或市乡村的税务署进行办理。在申告过程中，需要提交所得税的确定申告书，并记入必要事项。根据申报情况，确定最终应缴纳的税额。如果已缴的税金比应缴的税金多，可以申请退税。

地方税

都道府县税或市乡村税：除了国税外，留学生还需缴纳地方税，如都道府县税或市乡村税，具体金额根据居住地的不同而异。

免税额度

留学生每年可以享受38万日元的免税额度。如果年收入不超过此额度，则不需要缴纳所得税。

退税

对于在日本大学排名较好的大学或大学院就读，并且留资格为“留学”的留学生，可能可以免除部分税金。决定归国时，可以向税务署申请退还在日本留学期间打工交纳的税金。

建议：

留学生在打工前应了解相关税法规定，确保按时申报和缴纳应缴税金。

如果有需要，可以咨询学校的财务部门或税务顾问，以获得更详细的指导和帮助。

注意保留相关凭证和记录，以便在需要时进行退税申请。