员工违章作业的处理需要遵循一定的程序和方法，以确保处理的有效性和公正性。以下是一些常见的处理方式：

批评教育：

首先应对违章员工进行批评教育，使其认识到违章操作的严重后果，并引导其改正错误。可以通过培训、讲座等形式进行宣传教育。

经济处罚：

根据违章行为的严重程度，可以对员工进行经济处罚，如罚款、扣除工资等。但需注意，处罚金额和方式应事先在公司内部依法制定并公示，且每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。

行政处分：

对于严重违章行为，可给予行政处分，如警告、记过、记大过、降级、撤职、留用察看、开除等。

重新培训：

对于违章员工，可安排重新进行标准化作业培训，确保其掌握正确的操作方法和安全知识。

岗位调整：

对于屡教不改或严重违章的员工，可考虑调整其岗位，甚至解除劳动合同。

法律追究：

若违章行为构成犯罪，应依照刑法有关规定追究刑事责任。

在处理违章作业时，应避免以下不当做法：

唠叨：避免无休止的重复批评，这样容易引起员工反感。

揭短：不要不分场合地公开批评，尤其是对年轻员工。

转移责任：不要将他人的误操作错误地归咎于其他员工。

审问式训斥：应了解原因，避免不分青红皂白的训斥。

总之，处理员工违章作业时，应坚持公平公正的原则，通过教育、处罚和岗位调整等多种手段，促使员工改正错误，提高安全意识，保障生产安全。