在学校保留学籍当兵的流程如下：

报名应征

高校新生或大学在校生在报名应征时，需在全国征兵网打印填写《应征入伍普通高等学校录取新生保留入学资格申请表》（以下简称《申请表》），一式两份。

或者到县级征兵办公室领取《申请表》，一式两份。

提交申请

批准入伍后，新兵本人或受委托人将此表（两份）交县级征兵办公室。

县级征兵办公室原则上在完成新兵交接手续之后5个工作日内，汇总入伍高校新生《申请表》，加盖公章后连同《入伍通知书》复印件发送相关高校招生部门。

学校审核

学校收到入伍高校新生《申请表》和《入伍通知书》复印件后，依法依规审核录取资格，办理保留入学资格手续。

在中国高等教育学生信息网，高校在学生个人信息中标注“参军入伍”。

在《保留入学资格申请表》上加盖公章，并出具《保留入学资格通知书》。

保留学籍

《保留入学资格申请表》一份由学校留存备案，一份交征兵办备案。

学校会为学生发《保留入学资格通知书》，并交由学生本人或委托人保管。

退役后复学

大学生退役之后（退伍当年或第二年），到原所在系（部）领取复学申请表（一式三份），经所在院（系）主任、学生处处长、教务处处长签字后将复学申请交教务处办公室，办理恢复学籍手续。

建议：

具体流程可能因学校不同而有所差异，建议咨询所在学校或当地教育部门。

退役后办理复学的时间有限制，一般需要在9月30日之前。

以上流程和所需材料可能因地区和学校而有所不同，建议在办理前详细咨询当地征兵办公室和学校相关部门，以确保流程顺利进行。