如果您的档案已经在学校存放了多年，您应该尽快采取以下步骤来确保档案的安全和有效管理：

确认档案状态

首先，联系您的毕业学校，了解档案当前的状态和存放地点。如果档案仍在学校，询问是否有超过保管期限的情况，以及是否需要办理转出手续。

办理调档手续

如果档案尚未超过保管期限，您应根据自己的就业情况，向学校申请调档。您可以选择将档案调转到工作地的人才中心或其他指定的档案管理机构。

如果档案已经超过保管期限，您需要先确定一个合适的档案接收地，然后按照学校的要求办理调档手续。通常需要提供调档函，并确保档案在调转过程中安全无损。

考虑档案的长期管理

如果您目前没有找到工作或档案接收地，可以考虑将档案挂靠在人才市场。这样，档案可以计入工龄，并在您找到工作时方便办理相关手续。

注意档案的法律要求

档案不能长期保存在个人手中，也不能私自拆开。如果档案变成“死档”，您需要到人才服务中心办理激活手续。

备份重要材料

在办理档案调转或存放时，确保将所有重要的学籍材料、学历证明等一并整理，并备份复印件，以备不时之需。

及时更新档案信息

如果您在毕业后有新的学历、职称或其他重要信息，应及时将这些信息更新到档案中，并保持档案的活跃状态。

通过以上步骤，您可以确保档案得到妥善管理，避免因长时间存放而导致的问题。建议您尽早与学校或相关机构联系，了解具体的档案管理和调转流程，以确保档案的安全和有效利用。