留学生申请两方协议（即两方就业协议）的流程如下：

直接签订两方就业协议

留学生在毕业后，可以参加社会招聘或网上招聘，直接与用人单位签订两方就业协议。

使用教育部学历认证书

留学生可以拿到教育部的留学归国人员学历认证书后，直接与用人单位签订就业合同。

学校开具证明

如果学校没有发放三方协议，留学生可以请求学校开具相关证明，或者通过学校就业指导部门协助办理。

提交材料

将准备好的材料提交给学校，等待学校审核材料。

签订协议

留学生审核通过后，需要在现场和学校签订三方协议。

办理手续

完成签订后，留学生需要办理一些相关手续，如缴纳学费等。

注意事项

了解就业条件：外国学生来我国留学，要符合在我国就业的条件，才能在本校参加校园招聘，找工作单位签订三方协议就业，否则，他们只有回他本国就业。

注意协议细节：在签订两方协议时，留学生需要注意协议的条款和细节，确保自己的权益得到保障。

及时办理手续：签订协议后，留学生需要及时办理相关的手续，如缴纳学费、办理就业登记等。

建议留学生在签订两方协议前，详细了解协议的内容和条款，确保自己的权益得到保障，并及时办理相关的手续。