自主就业和复员的主要差别在于 就业主体和方式的不同。

就业主体不同

复员：是指退伍军人经过一定的培训和安置，回到社会上重新开始工作，成为一名普通的职工。复员过程由国家主导，提供就业机会和安置服务，为退役军人提供更稳定的就业环境。

自主就业：是指退伍军人自己创业或从事自己感兴趣的工作，独立承担风险和责任，实现自我价值的同时也为社会做出贡献。自主就业是一种由个人或企业主导的就业形式，需要退伍军人具备更多的创业能力和经营技巧。

就业方式不同

复员：复员后，军人会接受国家相关部门的安排和安置，进入普通工作岗位，继续从事工作和生产活动。这种方式更侧重于为退役军人提供稳定的就业环境。

自主就业：自主就业则是指个人自主选择职业或创业，在市场经济的环境下自负盈亏、自主经营。这种方式需要退伍军人具备更多的创业能力和经营技巧，同时也需要更大的勇气和毅力去面对风险和挑战。

政策背景不同

复员：复员政策通常与特定的历史时期和军事制度相关，随着《退役士兵安置条例》的实施，复员的方式和待遇有所改变。

自主就业：自主就业是《退役士兵安置条例》实施后出现的一种新型安置方式，旨在鼓励和支持退伍军人自主创业和就业。

综上所述，复员和自主就业在就业主体、方式和政策背景等方面存在明显差异。复员更侧重于国家提供的稳定就业机会和安置服务，而自主就业则强调个人创业和独立承担风险的能力。